(一)實驗目的
1.掌握FISH技術的一般原理,及其基本實驗方法;
2.了解FISH技術的發(fā)展概況,以及應用范圍。
(二)實驗原理
FISH是以分子雜交為基礎,應用非放射性熒光物質標記核酸探針,通過堿基互補的原理與靶DNA雜交,在核中或染色體上顯示靶DNA序列位置的方法。FISH技術可分為四個步驟:樣品制備、探針標記、雜交及其檢測。
(三)實驗準備
1.材料染色體標本或血涂片
2.試劑甲醇、乙醇、乙酸、標記探針(生物素標記探針或地高辛標記探針)、3mol/L乙酸鈉、甲酰胺(分子生物學級和粗制品)、雜交緩沖液(4×SSC,20%硫酸葡萄糖)、鮭精DNA、磷酸鈉、Tween20、BSA、檢測液(5μg/ml熒光素偶聯(lián)的親和素或6μg/ml羅丹明偶聯(lián)的抗地高辛抗體)DAPI
3.儀器低溫高速離心機、熒光顯微鏡、MixPlus旋渦混合器、移液器、恒溫水浴鍋、培養(yǎng)箱、烤箱
(四)實驗方法與步驟
1.探針混合與變性
(1)混合20~60ng標記探針DNA和3~5μg鮭精DNA。反應后體積少于10μl,可直接凍干;若體積較大,可加1/20體積的3mol/L乙酸鈉和2倍體積100%乙醇沉淀DNA。混勻并于-70℃30min。在4℃,12000r/min離心10min,棄上清,沉淀物以300μl70%乙醇洗滌后在離心(同上),棄上清,凍干。
(2)將DNA重懸于5μl去離子的甲酰胺中,室溫旋渦混勻3min。
(3)加入5μl雜交緩沖液,,MixPlus旋渦混合器中混勻5min。
(4)將DNA探針置于75℃水浴中變性5min。迅速置于冰浴中5min,備用。
2.樣本處理
(1)染色體制備標本或血涂片在室溫下依次用70%、90%、100%的乙醇脫水,各5min。涼干備用。
(2)變性前將載玻片置60℃烤箱內孵育,目的是防止變性液加至載玻片時溫度降低。
(3)將變性液在水浴箱中加熱至70℃。
(4)將預熱的載玻片移至含變性液(70%去離子甲酰胺、2×SSC和50mmol/L磷酸鈉)的Coplin廣口瓶內2min。
(5)立即將載玻片依次移入70%、90%和100%預冷的乙醇中,各5min。防止DNA復性。
(6)空氣干燥。
3.雜交
(1)將10μl含變性探針的雜交混合液加至載玻片上變性的靶DNA上。
(2)在雜交液上蓋上蓋玻片,防止產(chǎn)生氣泡。
(3)用橡膠泥將蓋玻片四周封好,并置濕盒內37℃溫浴過夜。
4.檢測
(1)從濕盒內取出載玻片,除去橡膠泥。
(2)將載玻片置于42℃預溫的漂洗液A(50%甲酰胺,2×SSC)中,在恒溫水浴搖床中振蕩10min,并使蓋玻片脫落。更換漂洗液A兩次,每次振蕩5min。
(3)將載玻片移入60℃預溫的漂洗液B(1×SSC~0.1×SSC,pH7.0,根據(jù)實驗需要調整。),漂洗5min,更換漂洗液B兩次,每次5min。
(4)將載玻片取出,甩盡液體,加200μl封閉液(3%BSA,4×SSC,0.1%Tween20),蓋上蓋玻片,防止氣泡產(chǎn)生,置于濕盒內,37℃溫浴30min以上。
(5)移去蓋玻片,除去多余液體,加200μl檢測液(5μg/ml熒光素偶聯(lián)的親和素或6μg/ml羅丹明偶聯(lián)的抗地高辛抗體,緩沖液為1%BSA、4×SSC和0.1Tween20),在37℃濕盒內溫浴30min。
(6)移去蓋玻片,將載玻片置于漂洗液C(4×SSC,0.1%Tween20,pH7.0)中,42℃振蕩漂洗3次,各5min。
(7)將載玻片置于復染液(2×SSC,200ng/mlDAPI)中,室溫振蕩20min。
(8)載玻片在漂洗液D(2×SSC,0.05%Tween20)中室溫溫育1min~2min。
(9)熒光顯微鏡下觀察。
1.掌握FISH技術的一般原理,及其基本實驗方法;
2.了解FISH技術的發(fā)展概況,以及應用范圍。
(二)實驗原理
FISH是以分子雜交為基礎,應用非放射性熒光物質標記核酸探針,通過堿基互補的原理與靶DNA雜交,在核中或染色體上顯示靶DNA序列位置的方法。FISH技術可分為四個步驟:樣品制備、探針標記、雜交及其檢測。
(三)實驗準備
1.材料染色體標本或血涂片
2.試劑甲醇、乙醇、乙酸、標記探針(生物素標記探針或地高辛標記探針)、3mol/L乙酸鈉、甲酰胺(分子生物學級和粗制品)、雜交緩沖液(4×SSC,20%硫酸葡萄糖)、鮭精DNA、磷酸鈉、Tween20、BSA、檢測液(5μg/ml熒光素偶聯(lián)的親和素或6μg/ml羅丹明偶聯(lián)的抗地高辛抗體)DAPI
3.儀器低溫高速離心機、熒光顯微鏡、MixPlus旋渦混合器、移液器、恒溫水浴鍋、培養(yǎng)箱、烤箱
(四)實驗方法與步驟
1.探針混合與變性
(1)混合20~60ng標記探針DNA和3~5μg鮭精DNA。反應后體積少于10μl,可直接凍干;若體積較大,可加1/20體積的3mol/L乙酸鈉和2倍體積100%乙醇沉淀DNA。混勻并于-70℃30min。在4℃,12000r/min離心10min,棄上清,沉淀物以300μl70%乙醇洗滌后在離心(同上),棄上清,凍干。
(2)將DNA重懸于5μl去離子的甲酰胺中,室溫旋渦混勻3min。
(3)加入5μl雜交緩沖液,,MixPlus旋渦混合器中混勻5min。
(4)將DNA探針置于75℃水浴中變性5min。迅速置于冰浴中5min,備用。
2.樣本處理
(1)染色體制備標本或血涂片在室溫下依次用70%、90%、100%的乙醇脫水,各5min。涼干備用。
(2)變性前將載玻片置60℃烤箱內孵育,目的是防止變性液加至載玻片時溫度降低。
(3)將變性液在水浴箱中加熱至70℃。
(4)將預熱的載玻片移至含變性液(70%去離子甲酰胺、2×SSC和50mmol/L磷酸鈉)的Coplin廣口瓶內2min。
(5)立即將載玻片依次移入70%、90%和100%預冷的乙醇中,各5min。防止DNA復性。
(6)空氣干燥。
3.雜交
(1)將10μl含變性探針的雜交混合液加至載玻片上變性的靶DNA上。
(2)在雜交液上蓋上蓋玻片,防止產(chǎn)生氣泡。
(3)用橡膠泥將蓋玻片四周封好,并置濕盒內37℃溫浴過夜。
4.檢測
(1)從濕盒內取出載玻片,除去橡膠泥。
(2)將載玻片置于42℃預溫的漂洗液A(50%甲酰胺,2×SSC)中,在恒溫水浴搖床中振蕩10min,并使蓋玻片脫落。更換漂洗液A兩次,每次振蕩5min。
(3)將載玻片移入60℃預溫的漂洗液B(1×SSC~0.1×SSC,pH7.0,根據(jù)實驗需要調整。),漂洗5min,更換漂洗液B兩次,每次5min。
(4)將載玻片取出,甩盡液體,加200μl封閉液(3%BSA,4×SSC,0.1%Tween20),蓋上蓋玻片,防止氣泡產(chǎn)生,置于濕盒內,37℃溫浴30min以上。
(5)移去蓋玻片,除去多余液體,加200μl檢測液(5μg/ml熒光素偶聯(lián)的親和素或6μg/ml羅丹明偶聯(lián)的抗地高辛抗體,緩沖液為1%BSA、4×SSC和0.1Tween20),在37℃濕盒內溫浴30min。
(6)移去蓋玻片,將載玻片置于漂洗液C(4×SSC,0.1%Tween20,pH7.0)中,42℃振蕩漂洗3次,各5min。
(7)將載玻片置于復染液(2×SSC,200ng/mlDAPI)中,室溫振蕩20min。
(8)載玻片在漂洗液D(2×SSC,0.05%Tween20)中室溫溫育1min~2min。
(9)熒光顯微鏡下觀察。
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