實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 的結(jié)果分析--實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 常用名詞
校正染料 (ROX)
校正加樣誤差或孔與孔之間的誤差,提供一個(gè)穩(wěn)定的基線,極大地改進(jìn)定量的精確 度,提高重復(fù)管之間的數(shù)據(jù)重現(xiàn)性。
注意:不同的儀器對(duì) ROX 的需求不同。
基線
PCR 的最初幾個(gè)循環(huán),在 此基線上熒光信號(hào)幾乎沒(méi)有變化。
閾值
可以相信的最小熒光值。
CT 值
擴(kuò)增曲線與閾值交點(diǎn)的橫坐標(biāo)。
二、結(jié)果有效性判斷
融解曲線單峰 ( 染料法 )
擴(kuò)增曲線指數(shù)擴(kuò)增區(qū)域,復(fù)孔間 CT 值 STD<0.2
閾值設(shè)置合理
閾值位于指數(shù)增長(zhǎng)期:儀器會(huì)自動(dòng)計(jì)算閾值,但并非所有情況下儀器計(jì)算結(jié)果都是 合理的,必要時(shí)進(jìn)行手動(dòng)調(diào)整。
NTC 確認(rèn)無(wú)氣溶膠污染或可以忽略
NTC = No Template Control (qPCR 反應(yīng),模板以水代替 );
若 ΔCT=NTC (CT 值 ) - 目的基因 (CT 值 ) ≥3 或 ≥5,可認(rèn)為體系中氣溶膠污染不會(huì) 影響到實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。
NRT 確認(rèn)無(wú)基因組殘留或可以忽略
NRT=No RT Control ( 逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中,除逆轉(zhuǎn)錄酶組分,其余組分正常添加 );
若 ΔCT=NRT (CT 值 ) - 目的基因 (CT 值 ) ≥3 或 ≥5,可認(rèn)為體系中基因組殘留不會(huì) 影響到實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。
待測(cè) CT 值于線性范圍內(nèi)
擴(kuò)增效率符合近似計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)
PCR 擴(kuò)增效率 (e) 介于 90%-120% 之間
安培生物致力成為推動(dòng)生命科學(xué)進(jìn)步值得信賴(lài)的合作者
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