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精選案例匯總 | MST技術(shù)在植物抗病機(jī)制研究上的應(yīng)用

來(lái)源:諾坦普科技(北京)有限公司   2022年11月10日 10:51  



植物案例

MST技術(shù)

植物在整個(gè)生命周期中會(huì)經(jīng)受多種微生物病原的侵襲,包括真菌,細(xì)菌,病毒,線蟲(chóng)等,作物約30%的產(chǎn)量損失是由病原體造成的,病害是農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展面臨的主要問(wèn)題。在植物與病原數(shù)百萬(wàn)年的協(xié)同進(jìn)化中,植物與病原的互作經(jīng)歷了很多階段,為掌握植物與病原互作中的重要信號(hào)分子,深入了解植物免疫分子機(jī)制,不可避免的要進(jìn)行分子間互作的檢測(cè),今天來(lái)看一下微量熱泳動(dòng)(MicroScale Thermophoresis, MST)分子互作技術(shù)在植物抗病方面的應(yīng)用吧!




1

植物與真菌--蛋白和離子

Gao, Mingjun, et al. "Ca2+ sensor-mediated ROS scavenging suppresses rice immunity and is exploited by a fungal effector." Cell 184.21 (2021): 5391-5404.




植物如何平衡抗病和生長(zhǎng)發(fā)育平衡,zhong國(guó)科xue院分子植物科學(xué)卓yue創(chuàng)新中心何祖華團(tuán)隊(duì)研究揭示了以ROD1為免疫抑制中樞,通過(guò)降解超氧活性因子ROS,抑制植物的免疫反應(yīng),平衡植物防御和生長(zhǎng)之間的沖突。


水稻中,ROD1編碼一種Ca2+傳感器蛋白,以Ca2+依賴的方式結(jié)合到磷酸肌醇脂質(zhì),靶向至特定膜區(qū)域。ROD1刺激過(guò)氧化氫酶CatB的活性,促進(jìn)活性氧(ROS)清除,抑制免疫;當(dāng)有稻瘟菌侵染時(shí),植物通過(guò)降解ROD1減弱其功能,產(chǎn)生有效的防衛(wèi)反應(yīng)。作者使用MST技術(shù)檢測(cè)ROD1可直接與Ca2+結(jié)合,并鑒定出活性結(jié)果位點(diǎn)。

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圖注:MST技術(shù)分析ROD1與Ca2+的親和力和活性結(jié)合位點(diǎn)


另一方面,研究發(fā)現(xiàn)病原稻瘟菌中具有與ROD1結(jié)構(gòu)類似的毒性蛋白AvrPiz-t,在植物體內(nèi)盜用ROD1的免疫抑制途徑,實(shí)現(xiàn)侵染的目的,進(jìn)而與病原菌共同生存。通過(guò)MST檢測(cè)到AvrPiz-t與Ca2+結(jié)合,進(jìn)而盜用ROD1途徑。


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圖注:MST技術(shù)比較ROD1和AvrPiz-t的Ca2+結(jié)合活性




2

植物與細(xì)菌--蛋白和蛋白(Dimmer)

Xu, Ning, et al. "A plant lectin receptor-like kinase phosphorylates the bacterial effector AvrPtoB to dampen its virulence in Arabidopsis." Molecular plant 13.10 (2020): 1499-1512.




質(zhì)膜定位受體樣激酶(RLKs)感知植物中保守的病原相關(guān)分子模式(PAMP),觸發(fā)免疫(PTI)。擬南芥凝集素受體激酶LecRK-IX已被證明調(diào)節(jié)細(xì)菌鞭毛蛋白來(lái)源肽flg22誘導(dǎo)的PTI。而許多病原體分泌的效應(yīng)蛋白可抑制植物免疫。植物中是否存在某種機(jī)制抑制或削弱病菌分泌的效應(yīng)蛋白的功能?


中科院微生物所劉俊研究組研究發(fā)現(xiàn)效應(yīng)蛋白AvrPtoB是丁香假單胞菌的主要毒力效應(yīng)子。AvrPtoB C端有一個(gè)功能的E3連接酶結(jié)構(gòu)域,以植物中的鞭毛識(shí)別受體FLS2和幾丁質(zhì)識(shí)別受體CERK1為目標(biāo)進(jìn)行降解,導(dǎo)致PTI的抑制。本研究中,作者發(fā)現(xiàn)效應(yīng)蛋白AvrPtoB與擬南芥凝集素受體激酶LecRK-IX.2相互作用并泛素化降解LecRK-IX.2,抑制其介導(dǎo)的免疫。AvrPtoB在體外和體內(nèi)都能形成二聚體,這種二聚體形成對(duì)其E3連接酶與底物的結(jié)合和泛素化所必需的。然而, LecRK-IX.2能與AvrPtoB S335位點(diǎn)互作并使其磷酸化,S335的磷酸化破壞AvrPtoB二聚體狀態(tài),導(dǎo)致其抑制PTI反應(yīng)的毒力下降。作者的研究表明,宿主RLKs可以修飾病原體效應(yīng)器,以抑制其毒性,并削弱其抑制PTI的能力。




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圖示:AvrPtoB對(duì)LecRK-IX.2的泛素化與其被磷酸化競(jìng)爭(zhēng)模式圖




為了檢測(cè)AvrPtoB與自身以及與LecRK-IX.2親和力大小,作者進(jìn)行MST實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,AvrPtoB與LecRK-IX.2的親和力(0.02μM)要遠(yuǎn)高于其自身形成二聚體的親和力(18.7μM),表明AvrPtoB更容易與LecRK-IX.2結(jié)合。


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圖注:MST技術(shù)檢測(cè)AvrPtoB自身以及與LecRK-IX.2CD




3

植物與病毒--蛋白與離子/核酸/蛋白

Yao, Shengze, et al. "The key micronutrient copper orchestrates broad-spectrum virus resistance in rice." Science Advances 8.26 (2022): eabm0660.




銅是植物生長(zhǎng)發(fā)育的重要調(diào)節(jié)劑,然而銅對(duì)病毒入侵的反應(yīng)機(jī)制尚不清楚。之前的研究表明,SPL9介導(dǎo)的miR528轉(zhuǎn)錄激活為已建立的AGO18- miR528 - L- AO抗病毒防御增加了一個(gè)調(diào)控層。北京大學(xué)李毅課題組研究發(fā)現(xiàn),Cu2+通過(guò)抑制SPL9的蛋白水平來(lái)抑制miR528的轉(zhuǎn)錄激活,進(jìn)而提高ROS水平,增強(qiáng)AO積累量及其酶活,從而加強(qiáng)抗病毒反應(yīng),闡明了銅穩(wěn)態(tài)的分子機(jī)制、調(diào)控網(wǎng)絡(luò)以及SPL9-miR528-AO抗病毒途徑。


為了檢測(cè)SPL9和Cu2+之間的直接相互作用,作者純化了SPL9 DNA結(jié)合區(qū)域(SPL9 SBP),使用Monolith分子互作儀檢測(cè)其與Cu2+的互作。結(jié)果顯示SPL9 SBP直接與Cu2+結(jié)合,但不與Ca2+結(jié)合。




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圖注:Monolith檢測(cè)SPL9與Cu2+親和力


此外,李毅課題組在2020年研究結(jié)果解析了植物體內(nèi)抗病毒RNAi信號(hào)通路,同樣用到了MST技術(shù)。

Yang, Zhirui, et al. "Jasmonate signaling enhances RNA silencing and antiviral defense in rice." Cell Host & Microbe 28.1 (2020): 89-103.

 

水稻抗病毒RNAi信號(hào)通路的核心蛋白AGO18受病毒侵染誘導(dǎo),進(jìn)而增強(qiáng)水稻的抗病毒免疫;但是病毒侵染如何誘導(dǎo)水稻AGO18的了解很少。北京大學(xué)李毅課題組發(fā)現(xiàn)病毒外殼蛋白(CP)過(guò)表達(dá)能夠誘導(dǎo)水稻茉莉酸(JA)的顯著積累,JA信號(hào)通路的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子(JAMYB)能夠結(jié)合并激活A(yù)GO18的啟動(dòng)子,從而誘導(dǎo)AGO18的表達(dá),抑制病毒的侵染。


為了分析AGO18啟動(dòng)子上的順式作用元件,作者進(jìn)行了MST實(shí)驗(yàn)。將順式作用元件帶上FAM熒光,作為熒光信號(hào)源,檢測(cè)到JAMYB結(jié)合在AGO18啟動(dòng)子上的順式作用元件R3,R3突變后AGO18和JAMYB喪失結(jié)合能力,進(jìn)而確定了該位點(diǎn)對(duì)于AGO18轉(zhuǎn)錄調(diào)控的重要性。


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圖3. MST檢測(cè)的JAMYB和AGO18 R3區(qū)域的結(jié)合(藍(lán)色曲線)


此外,作者通過(guò)MST實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),水稻JAZ6蛋白能夠通過(guò)與JAMYB相互作用來(lái)抑制其轉(zhuǎn)錄激活活性,表明JAZ6抑制水稻抗病毒RNA沉默并損害水稻抗病毒免疫反應(yīng)。


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圖2. MST檢測(cè)的JAMYB和JAZ6的結(jié)合


該研究揭示了植物JA信號(hào)通路與RNAi信號(hào)通路協(xié)同參與水稻抗病毒防御的分子機(jī)制。




4

植物與線蟲(chóng)--蛋白和多肽

Zhang, Xin, et al. "Nematode-encoded RALF peptide mimics facilitate parasitism of plants through the FERONIA receptor kinase." Molecular plant 13.10 (2020): 1434-1454.




植物寄生線蟲(chóng)是全qiu性的糧食作物病蟲(chóng)害之一,然而線蟲(chóng)與宿主植物相互作用的機(jī)理仍尚不清楚。植物細(xì)胞膜上的受體蛋白FERONIA及其配體RALFs參與調(diào)節(jié)植物免疫反應(yīng)。湖南大學(xué)和中國(guó)農(nóng)科院植物保護(hù)研究所聯(lián)合解析研究發(fā)現(xiàn)FERONIA突變導(dǎo)致植物對(duì)RKN表現(xiàn)出低敏感性。另外,作者在6類根結(jié)線蟲(chóng)中鑒定了18種RALF-like基因,編碼的小肽可以直接結(jié)合到FERONIA的胞外結(jié)構(gòu)域,從而“挾持”植物FER信號(hào)途徑,破壞植物免疫系統(tǒng),促進(jìn)寄生。


研究時(shí),為了檢測(cè)了線蟲(chóng)RALF- like小肽 MiRALF1/3是否同擬南芥At-RALF1具有相似的FER結(jié)合模式,作者使用MST進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果顯示MiRALF1/3與FERECD親和力分別是25μM和64μM,而AtRALF1親和力略高,Kd為1.7μM,證明了線蟲(chóng)RALF -like具有植物RALF的典型活性,且可以結(jié)合FER。


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圖注:MST檢測(cè)FERECD與AtRALF1、MiRALF1或MiRALF3之間的親和力


在病原物和植物的識(shí)別到特定的防衛(wèi)反應(yīng)過(guò)程中,二者通過(guò)互作進(jìn)行信號(hào)的傳導(dǎo),通過(guò)MST技術(shù)檢測(cè)明確二者互作過(guò)程中的識(shí)別,免疫激發(fā),通路調(diào)控和協(xié)同進(jìn)化的詳細(xì)機(jī)制,更好的分析和比較分子間作用和通路的調(diào)控。無(wú)論是植物和各種病原物的組織來(lái)源,均可在MST上完成檢測(cè),助力植物病理科學(xué)家們更好的解析植物和病原物的互作和協(xié)同進(jìn)化。



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