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NanoTemper工具為您的膜蛋白研究排憂解難!

來源:諾坦普科技(北京)有限公司   2022年11月10日 10:48  

● 研 究 難 點


在藥物開發和結構生物學研究領域中,有許多重要的靶點屬于膜蛋白,例如G蛋白偶聯受體(GPCRs),離子通道和膜轉運蛋白等等,涉及多種生化功能和疾病發生機理,因此一直是研究人員關注的熱點。


然而,膜蛋白的研究存在著不少難點。讓我們來看看NanoTemper公司的技術是如何幫助研究人員克服膜蛋白研究中的難題吧!





難題 1

膜蛋白難以純化,需要用去垢劑溶解,但有效提取膜蛋白的去垢劑不一定適宜純化及下游的生化實驗,需要快速且高通量篩選去垢劑的方法。

歐洲分子生物學實驗室的研究人員利用nanoDSF和Backreflection技術開發了一套膜蛋白的高通量篩選去垢劑的流程。


首先他們使用常用去垢劑DDM把蛋白提取出來,接下來將待篩選的去垢劑預裝至96孔板中,把提取出來的蛋白直接進行稀釋,孵育一小時后使用蛋白穩定性分析儀Promethus檢測蛋白的Tm與Tagg值。根據檢測到的數據,研究人員制作出熱圖,圖中深綠色的條件代表目標膜蛋白在該去垢劑中Tm與Tagg值較高,狀態接近于天然的構象,而紅色則代表該去垢劑會使目標膜蛋白變性。


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難題 2


使用脂質立方相(LCP)這一種類膜環境中結晶膜蛋白,由于LCP的粘稠性以及相行為,使用基于染料的DSF或DSC的方法來評估蛋白的穩定性基本是不可行的。

使用LCP的結晶方法需要篩選不同的脂質和添加物,把每個LCP組成條件放在許多不同的沉淀劑緩沖液中試驗結晶。為了找到良好的LCP條件,zui大限度地提高膜蛋白的穩定性,以減少不同結晶試驗的次數,愛爾蘭科學家使用Promethus蛋白穩定性分析儀進行了脂立方相中的膜蛋白穩定性檢測,并建立了一套方法學,用來快速篩選膜蛋白介觀結晶的LCP條件。


以膜蛋白LntEco為例,研究人員首先檢測了它在9.9 MAG制備的LCP中的熱變性曲線和聚集曲線,然后在脂立方相中進行了與結晶相關的多種處理,包括使用不同的脂質主體、附加脂質體和配體,再用nanoDSF技術檢測得到其Tm值的變化,以反映出該種處理方法對LntEco的熱穩定性的影響。這一系列的測試也證明了無標記的nanoDSF技術能夠在非常粘稠的LCP中測量膜蛋白的穩定性,幫助研究人員在膜蛋白結晶試驗之前篩選LCP的條件。


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難題 3

在表征膜蛋白功能時,需要在類膜的環境中保持它的天然結構和功能

Nanodiscs可使膜蛋白處于類似磷脂雙分子層的環境中,從而模擬膜蛋白在細胞膜中的構象和生物學功能;因此, Nanodiscs在膜蛋白領域的研究工作起到很大的作用。


2020年,德國工業大學的研究人員就利用了Nanodisc這一工具研究了甘氨酸受體 (GlyR) 在類膜環境中表現出的配體特異性的構象變化(圖a),并通過NanoTemper公司的Monolith分子互作儀檢測了GlyR與其激動劑的相互作用。


為了分析GlyR隨著完quan激動劑glycine的濃度改變而產生的構象變化,研究人員以Nanodisc溶解的His-GlyR純化蛋白作為target,glycine作為ligand進行了MST實驗,得到EC50= 65 ± 22.8 μM(圖b),這與通過電生理學方法獲得的表觀EC50值相似。


接下來,研究人員以GlyR與不完quan激動劑taurine的相互作用為研究對象,對比了完quan和不完quan激動劑所產生的MST信號差異。在這次實驗中,研究人員使用卵母細胞表達GlyR-GFP蛋白,并以加入Nanodiscs的細胞裂解液溶作為target直接進行檢測,無需純化GlyR蛋白。結果顯示GlyR與taurine 結合的EC50 = 473.8 ± 46.1 μM,親和力小于Glycine,與預期一致(圖c)。以此數據為基礎,研究人員推導出由兩種激動劑引起的GlyR構象變化模型。


這項研究揭示了GlyR由特定激動劑誘導的構象特征,和在自然環境中配體結合決定受體激活的機制。對于低豐度且難以純化和固定的膜蛋白,Monolith分子互作檢測儀可以實現免純化檢測,直接得到膜蛋白在細胞裂解液中與配體的親和力,在保證膜蛋白處于天然環境中,最da程度維持其構象和功能的同時節省您制備樣品的時間。


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(圖a)Nanodiscs中的GlyR 示意圖


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(圖b) MST檢測GlyR與Glycine 結合的親和力




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(圖c) MST檢測GlyR與與Glycine和Taurine結合的親和力




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