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目前，越來越多的工業化實驗室和科研院所的實驗室開始使用機器人或自動化儀器開展日常工作和科學研究。費時、費力的重復性工作實現自動化在許多行業已經成為趨勢，例如食品加工業、藥物篩選以及基因組測序。與傳統的手工操作方法相比，這種自動化不但大大提高了工作效率，而且極大地減少了人工操作可能帶來的錯誤。
除了微生物基因分型實驗室，自動化液體工作站還能夠用在食品檢測實驗室、法醫學實驗室等多種實驗室中。除此之外，自動化液體工作站還有更廣泛的應用實驗領域：
1. 定量 PCR。此類的實驗不同于定性 PCR 反應，對樣品處理需要更高的精確度和準確度，以避免由于加樣的實驗誤差，而造成假性的高反應產物。配合定量PCR，可以保證反應結果的可靠性。
2. 酶標反應。由于可更換的吸嘴，可以避免傳統的管道式加樣導致的反應物的污染。
3. 熒光和化學發光高通量檢測蛋白。配合讀板式的熒光和化學發光高通量的蛋白檢測儀，更高效率、更準確地定量蛋白質。
4. 基因工程等，如可以將需要的細胞或者細菌克隆從 24 板或者其他的培養中取出，按照自己設計的次序，重新排列克隆。
5. 生物制劑或者生物制藥中試試驗。自動化液體工作站除了可以處理板與板之間的液體轉移，還可處理管與板，或者玻璃試管與離心管等等其他大多數自動加樣工作站無能為力的特殊加樣工作，所以其應用可涉及更廣的范圍。
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